基于四個(gè)條形碼聯(lián)合片段構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育鄰接樹,顯示杜鵑屬植物亞屬和組水平上的鑒定率
杜鵑屬(Rhododendron)是中國(guó)種子植物最大的屬,在中國(guó)有590種左右(包括近年來(lái)發(fā)表的新種),占全球該屬植物的60%。喜馬拉雅-橫斷山區(qū)是杜鵑屬植物的起源和分化中心之一,分布有317種杜鵑花,其中210種為本地區(qū)特有種,占中國(guó)杜鵑屬物種數(shù)的55.5%?焖佥椛湮锓N形成和種間自然雜交導(dǎo)致杜鵑屬不同物種間形態(tài)界限模糊,物種的準(zhǔn)確鑒定非常困難,被認(rèn)為是最困難的分類類群之一。
最近,中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所高連明研究組和李德銖研究組合作,利用四個(gè)DNA條形碼片段(ITS、psbA-trnH、matK和rbcL)對(duì)分布于喜馬拉雅-橫斷山區(qū)的173種(531個(gè)個(gè)體)杜鵑花進(jìn)行了DNA條形碼研究。研究結(jié)果表明,不同的分析方法(NJ,PWG和BLAST)對(duì)物種的鑒別率有所不同,BLAST分析通常能得到最高的物種鑒別率,而基于系統(tǒng)發(fā)育鄰接樹(NJ)分析法得到的物種鑒別最低,使用不同分析方法得到的物種分辨率之間不易直接比較。基于PWG的鑒定結(jié)果,四個(gè)DNA條形碼對(duì)杜鵑屬物種鑒別率介于12.21%-25.19%之間,鑒別成功率依次為ITS
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