摘要 簡要介紹了利用Macromedia Flash MX構(gòu)建DNA結(jié)構(gòu)模型的過程,做出的課件能從平面、立體、動態(tài)、靜態(tài)多個維度展示DNA的結(jié)構(gòu)以及DNA結(jié)構(gòu)中各成分之間的連接關(guān)系和空間位置關(guān)系。
關(guān)鍵詞 Flash MX DNA結(jié)構(gòu)模型 構(gòu)建
1.問題的提出
在《DNA分子的結(jié)構(gòu)》一節(jié)中,現(xiàn)行教材(人教版高中生物(必修)第二冊)提供了DNA分子的結(jié)構(gòu)模式圖(見課本P8,圖6-5),通過平面和立體結(jié)構(gòu)說明DNA分子中有關(guān)成分之間的連接關(guān)系和位置關(guān)系。借此,學生對DNA結(jié)構(gòu)內(nèi)部成分之間的聯(lián)系能較好的理解和掌握;但是由于空間所限,對DNA各成分之間的空間位置關(guān)系在理解上仍然存在一定的認知難度。為此,教材安排了實驗十(制作DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型),但是制作出來的模型只是平面結(jié)構(gòu)上的螺旋,缺乏足夠的說服力。
目前,互聯(lián)網(wǎng)上有許多教學課件,但是幾乎看不到DNA結(jié)構(gòu)模型的課件,筆者有機會見到一個,也只是表現(xiàn)DNA的雙螺旋狀態(tài),沒有體現(xiàn)各成分間的空間位置關(guān)系。
Macromedia Flash MX是制作二維矢量動畫的有效工具,能不能利用Flash MX矢量圖畫功能制作更好的DNA立體空間螺旋模型呢?筆者進行了嘗試,現(xiàn)將制作過程簡述如下,以饗同行。
2.元件的制備
2.1 脫氧核糖 建立新元件,命名為“脫氧核糖”,利用直線工具繪制一個五邊形,填充合適顏色,并去掉邊框(圖1,附后,下同)。
2.2 含氮堿基 建立新元件,命名為“A”,利用直線工具繪制一個矩形,并去掉兩角,填充合適顏色,去掉邊框;用文字工具在上面添加字母“A”,即為腺嘌呤。用類似的方法制作元件“T”、“G”、“C” (圖2)。
2.3 磷酸 建立新元件,命名為“磷酸”,用橢圓工具繪制一個正圓,填充合適顏色,去掉邊框(圖3)。
2.4 脫氧核苷酸 建立新元件,命名為“腺嘌呤脫氧核苷酸”,按F11打開庫,拖出元件“A”、“磷酸”和“脫氧核糖”,按正確循序擺放在舞臺上,并用適當磅值的直線進行連接。同樣方法制作元件“胸腺嘧啶脫氧核苷酸”、“鳥嘌呤脫氧核苷酸”、 “胞嘧啶脫氧核苷酸” (圖4)。
2.5 氫鍵 建立新元件,命名為“二鍵”,用直線工具繪制兩條平行且等長的直線即可。同法可制作“三鍵”元件(圖5)。
2.6 核苷酸對 建立新元件,命名為“AT”。拖出元件“腺嘌呤脫氧核苷酸”放在圖層1,元件“胸腺嘧啶脫氧核苷酸”放在圖層2,元件“二鍵”放在圖層3。利用拖動工具把三個元件放在舞臺適當位置,注意氫鍵(二鍵)一定要連接到堿基A和T上。同法可制備核苷酸對“GC”,G與C之間用“三鍵”。為了便于構(gòu)建DNA分子平面、立體結(jié)構(gòu),最好再制備元件“TA”和“CG” (圖6)。
3.DNA結(jié)構(gòu)的構(gòu)建
3.1 平面結(jié)構(gòu) 建立新元件,命名為“平面結(jié)構(gòu)”。從庫中拖出元件 “AT”、 “TA”、 “GC”、 “CG”若干,按照從上到下的順序放置在舞臺不同層次的圖層中,并保持元件間距一致。用直線工具將左側(cè)相鄰的“磷酸”和“脫氧核糖”一一連接,同法連接右側(cè)。這樣,DNA的平面結(jié)構(gòu)就構(gòu)建完成了(圖7)。
3.2 立體結(jié)構(gòu)的構(gòu)建
3.2.1 立體動態(tài)結(jié)構(gòu)的構(gòu)建 DNA分子是規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu),從三維平面上反映出來的是各核苷酸對有一定的旋轉(zhuǎn)角度并且長度有一定的層次。因此首先要從構(gòu)建每一個核苷酸對的旋轉(zhuǎn)模型做起。
假設(shè)我們要構(gòu)建的DNA堿基序列從上到下為:
為了便于后面的操作,我們按照從后向前的順序一一制作各核苷酸對的旋轉(zhuǎn)模型。
建立新元件,命名為“立體動態(tài)模型1”。點擊菜單中的查看選項,在網(wǎng)格選項中點擊“顯示網(wǎng)格”,并確認顯示像素為18×18。拖出元件“GC”放到圖層1,水平居中。在圖層1的第15幀處插入關(guān)鍵幀,點擊菜單中的修改選項,在變形選項中點擊“順時針旋轉(zhuǎn)90度”,可以看到,在第15幀處,元件“GC”旋轉(zhuǎn)了90度。依次分別在圖層1的第30、45、60幀處作相同的工作,使元件“GC”每15幀旋轉(zhuǎn)90度。接著,在圖層1各幀之間建立動畫補間,使元件“GC”在第1幀到第60幀之間作360度的旋轉(zhuǎn)。
在圖層2中拖入元件“AT”,放置在元件“GC”所處網(wǎng)格的上面一個,水平居中。選中第1幀,點擊菜單中的修改選項,在變形選項中點擊“旋轉(zhuǎn)與縮放”,在彈出的對話框的旋轉(zhuǎn)項中輸入“20”,確定。這樣“AT”在第1幀處旋轉(zhuǎn)了20度。接著分別在圖層2的第15、30、45、60幀處插入關(guān)鍵幀,并使“AT”每15幀“順時針旋轉(zhuǎn)90度”。給圖層2各幀之間建立動畫補間,使元件“AT”在第1幀到第60幀之間作360度的旋轉(zhuǎn)。
依據(jù)相同的辦法分別構(gòu)建倒數(shù)第3對“TA”及以前核苷酸對的旋轉(zhuǎn)模型。所不同的是,每錯后一個位次,相應元件應該向上移動一個網(wǎng)格且水平居中,并在第1幀首先順時針旋轉(zhuǎn)(n-1)×20度,然后使它們分別在1至60幀之間旋轉(zhuǎn)360度。最后一個元件“TA”核苷酸對首先旋轉(zhuǎn)(19-1)×20= 360度。至此,在“立體動態(tài)模型1”元件下應該有19個圖層。
下面制作控制按鈕。建立按鈕元件,命名為“控制按鈕”。利用矩形工具繪制一個矩形,去掉邊框。進入“立體動態(tài)模型1”元件,插入新圖層20,確保圖層20在其它19個圖層的最上層。把元件“控制按鈕”拖入圖層20并調(diào)整大小,使其剛好覆蓋下面的所有19個元件,設(shè)置按鈕的alpha為0。在第60幀處插入幀。選定“控制按鈕”,為其添加按下時執(zhí)行stop命令。
建立新元件,命名為“立體動態(tài)模型”。拖入“立體動態(tài)模型1”元件并選定,利用自由變形工具使其上下徑縮小,直到該元件全部展示在舞臺上并且具有立體感。這時在場景中拖入“立體動態(tài)模型”元件并測試影片,我們就可以看到一個立體動態(tài)旋轉(zhuǎn)的DNA了。當我們用鼠標輕點該結(jié)構(gòu)的任何部位時,旋轉(zhuǎn)會停止,釋放后又旋轉(zhuǎn)起來。
3.2.1 立體靜態(tài)模型的構(gòu)建
建立新元件,命名為“立體靜態(tài)模型1”。進入“立體動態(tài)模型1”元件,同時選定圖層1到圖層19的第1幀并拷貝;氐健傲Ⅲw靜態(tài)模型1”元件,在以1幀處粘貼剛才拷貝的內(nèi)容。建立新元件,命名為“立體靜態(tài)模型”。拖入元件“立體動態(tài)模型1”,利用自由變形工具調(diào)整上下徑至與“立體動態(tài)模型”相當,這樣DNA的立體靜態(tài)模型就構(gòu)建成功了。
4.幾點說明和建議
4.1 該模型動態(tài)螺旋狀態(tài)自然流暢,各成分之間的連接關(guān)系和空間位置關(guān)系都很直觀,符合實用性原則。
4.2 構(gòu)建的DNA模型比較接近DNA分子結(jié)構(gòu)的真實性,如兩條脫氧核苷酸鏈之間距離相等、相鄰堿基對之間距離相等、每個螺旋包括10個堿基對等,符合科學性原則。
4.3 本課件制作過程涉及到的元件很多,元件的命名相當重要,既要遵循簡便性原則,又要考慮到方便操作。圖層也很多,制作時應盡可能做到一個元件占用一個圖層,不編輯時及時鎖定。
4.4 對齊工具對本課件的制作顯得尤為重要,居中之前要首先確保元件的旋轉(zhuǎn)中心在它的幾何中心,本文中除指明是水平居中之外,其他均指水平居中且垂直居中。
參考文獻
1.人民教育出版社生物室:《全日制普通高級中學教科書(必修)?生物?第二冊》,人民教育出版社2004年第2版,第8-10頁。
2. 人民教育出版社生物室:《全日制普通高級中學(必修)?生物第二冊?教師教學用書》,人民教育出版社2004年第2版,第13-14頁。
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